MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. Sakai plasmid pOSAK1

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002127	AGA	3	9	478	486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10955263
2	NC_002127	GCT	2	6	506	511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10955263
3	NC_002127	T	6	6	535	540	0 %	100 %	0 %	0 %	10955263
4	NC_002127	GGC	2	6	544	549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10955263
5	NC_002127	ACTG	2	8	574	581	25 %	25 %	25 %	25 %	10955263
6	NC_002127	AAG	2	6	597	602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10955263
7	NC_002127	A	6	6	626	631	100 %	0 %	0 %	0 %	10955263
8	NC_002127	AG	3	6	662	667	50 %	0 %	50 %	0 %	10955263
9	NC_002127	ATATT	2	10	968	977	40 %	60 %	0 %	0 %	10955264
10	NC_002127	T	6	6	986	991	0 %	100 %	0 %	0 %	10955264
11	NC_002127	ATG	2	6	1000	1005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10955264
12	NC_002127	T	8	8	1044	1051	0 %	100 %	0 %	0 %	10955264
13	NC_002127	TCA	2	6	1089	1094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10955264
14	NC_002127	T	7	7	1166	1172	0 %	100 %	0 %	0 %	10955264
15	NC_002127	ATT	2	6	1185	1190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10955264
16	NC_002127	A	8	8	1196	1203	100 %	0 %	0 %	0 %	10955264
17	NC_002127	CTTTT	2	10	1215	1224	0 %	80 %	0 %	20 %	10955264
18	NC_002127	AATA	2	8	1289	1296	75 %	25 %	0 %	0 %	10955264
19	NC_002127	T	6	6	1311	1316	0 %	100 %	0 %	0 %	10955264
20	NC_002127	T	6	6	1334	1339	0 %	100 %	0 %	0 %	10955264
21	NC_002127	T	6	6	1343	1348	0 %	100 %	0 %	0 %	10955264
22	NC_002127	CCA	2	6	1370	1375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10955265
23	NC_002127	GAT	2	6	1399	1404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10955265
24	NC_002127	GATT	2	8	1408	1415	25 %	50 %	25 %	0 %	10955265
25	NC_002127	AAAC	2	8	1462	1469	75 %	0 %	0 %	25 %	10955265
26	NC_002127	CA	3	6	1503	1508	50 %	0 %	0 %	50 %	10955265
27	NC_002127	TA	3	6	1558	1563	50 %	50 %	0 %	0 %	10955265
28	NC_002127	GTTT	2	8	1569	1576	0 %	75 %	25 %	0 %	10955265
29	NC_002127	TGA	3	9	1603	1611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10955265
30	NC_002127	CAT	2	6	1623	1628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10955265
31	NC_002127	AT	3	6	1639	1644	50 %	50 %	0 %	0 %	10955265
32	NC_002127	T	7	7	1710	1716	0 %	100 %	0 %	0 %	10955265
33	NC_002127	ATT	2	6	1718	1723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10955265
34	NC_002127	T	6	6	1741	1746	0 %	100 %	0 %	0 %	10955265
35	NC_002127	T	7	7	1813	1819	0 %	100 %	0 %	0 %	10955265
36	NC_002127	T	7	7	1841	1847	0 %	100 %	0 %	0 %	10955265
37	NC_002127	TGG	2	6	1980	1985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10955265
38	NC_002127	ATA	2	6	1988	1993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10955265
39	NC_002127	TTA	3	9	2018	2026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10955265
40	NC_002127	TCT	2	6	2027	2032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10955265
41	NC_002127	AGAA	2	8	2053	2060	75 %	0 %	25 %	0 %	10955265
42	NC_002127	TCA	3	9	2081	2089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10955265
43	NC_002127	TCA	2	6	2165	2170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10955265
44	NC_002127	AAGT	2	8	2171	2178	50 %	25 %	25 %	0 %	10955265
45	NC_002127	AAG	2	6	2240	2245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10955265
46	NC_002127	T	6	6	2288	2293	0 %	100 %	0 %	0 %	10955265

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.